Полный текст новости

Tesla Bio Workbench позволяет ученым делать новые открытия в бионауках

NVIDIA представляет систему Tesla BIO Workbench, которая позволяет ученым раздвинуть границы биологических исследований, превратив стандартный ПК в вычислительную лабораторию, способную обрабатывать сложные биологические коды в таких областях, как создание лекарств и определение последовательности DNA, со скоростью в 10-20 раз быстрее благодаря графическим процессорам NVIDIA Tesla.

Tesla Bio Workbench включает следующее:

  • набор оптимизированных под GPU бионаучных приложений для исследований в области молекулярной динамики и квантовой химии, включая AMBER, GROMACS, LAMMPS, NAMD, TeraChem, VMD, и приложений биоинформатики, таких, как CUDASW++ (Smith-Waterman), GPU-HMMER и MUMmerGPU;
  • сайт сообщества для загрузки новых приложений, проверки результатов тестов, чтения научных материалов и пособий, обсуждения на форумах с разработчиками приложений и многое другое — http://www.nvidia.ru/page/pg_57781.html.
  • подробная информация по рабочим станциям и кластерам на базе Tesla GPU для быстрой и удобной установки данных приложений.

Традиционно ученые в области молекулярной динамики и квантовой химии проводят эксперименты в лабораториях, где соединяют вещества, изучают новые свойства и измеряют эффективность инноваций.  Прогресс в вычислительной науке позволяет сегодня симулировать подобные эксперименты, однако для проведения подобных симуляций требуются мощные суперкомпьютеры с тысячами центральных процессоров (CPU). 

Благодаря массивно-вычислительной архитектуре CUDA графических процессоров NVIDIA, сегодня такие приложения можно ускорить в 10-20 раз – это значит, что даже один ПК с GPU Tesla теперь может легко обогнать суперкомпьютер.

Отзывы представителей науки:

"Мы работаем над новой техникой на базе GPU в приложении для визуализации в области молекулярной динамики, которая изучает, как маленькие молекулы, такие, как кислород или CO2, мигрируют в белки.  Эти исследования важны для изучения механизмов ферментативной реакции", - рассказывает Джон Стоун (John Stone), старший программист в Университете Иллинойса в Урбана-Кампейн. “Симуляции, которые занимают один день на рабочей станции с GPU, раньше длились 30 дней на машине с CPU, что малоэффективно для настоящих исследований”.

“TeraChem – это мощный пакет по молекулярному моделированию, с помощью которого можно просчитать состав новых лекарств, при этом не тратя время не синтез бесперспективных кандидатов”, - отмечает Тодд Мартинез (Todd Martinez), профессор по физической и теоретической химии в Стэнфордском Университете. “С помощью TeraChem вычисления, раньше занимавшие несколько дней или даже недель на кластере, теперь быстро выполняются на рабочих станциях с GPU NVIDIA. Это позволяет нам мгновенно проводить тщательную фильтрацию результатов и ускорять процесс создания лекарств”.

“Используя AMBER для  симуляции гидролиза ферментов целлюлозы, Cellobiohydrolaze-I, который является ключевым компонентом для повышения эффективности производства этанола, мы обнаружили, что производительность одного GPU NVIDIA эквивалентна кластеру из 10 узлов”, - отмечает Росс Уолкер (Ross Walker), профессор суперкомпьютерного центра Сан-Диего, UC San Diego.

"В нашем центре ученые используют GPU-приложения по молекулярной динамики NAMD, чтобы изучить, как клетки вирусов реагируют на разные вещества, включая изучение эффективности действия лекарств на вирус H1N1", - рассказывает Клаус Шултен (Klaus Schulten), профессор физики, директор службы NIH по молекулярному моделированию и биоинформатики и содиректор Центра NSF по физике живых клеток в Университете Иллинойса в Урбана-Кампейн. “Приложение NAMD работает на рабочей станции с 4 GPU быстрее, чем в группе серверов с 16 CPU”.

"Одна из приоритетных задач в молекулярных симуляциях – это автоматическая проверка лекарств. Мы традиционно использовали GROMACS для вычислений привязки лекарств к мембранным белкам на больших кластерах, но это дорогой и сложный способ”, - сказал Эрик Линдал (Erik Lindahl), адъюнкт-профессор в Центре Биомембранных Исследований в Стокгольмском Университете. “Сейчас мы добавляем GPU, потому что один GPU в 4-5 раз быстрее CPU в большинстве обычных симуляций. Мы думаем, что уже через несколько лет рабочие станции с несколькими картами займут большую часть рынка, и именно поэтому мы видим в компании NVIDIA очень важного партнера“.

Источник: Technograd.com

Новости партнеров:


Другие мировые новости за 29.01.2010:

Стив Джобс представил интернет-планшет Apple
Канадцы создали компьютерную мышь без мыши
LED обгонит CCFL на мировом рынке крупных ЖК-панелей
Oracle выходит на рынок аппаратного обеспечения
Tesla Bio Workbench позволяет ученым делать новые открытия в бионауках
Тесты, обзоры, статьи, аналитика
Инновации в медицине
Тема инноваций в области медицинских товаров является актуальной и касается каждого. Сегодня использование больших данных, искусственного интеллекта и других технологий стимулирует внедрение медицинских новшеств по всему миру. Новые методы профилактики, диагностики и контроля заболеваний, а также инновационные препараты и техники для мониторинга и лечения обещают значительно улучшить качество жизни людей.
CRM системы для повышения B2B продаж
CRM – оченеь эффективный инструмент для повышения продаж в сегменте B2B. Платформа удобна менеджерам для фиксации каждого шага работы с клиентом, руководителю – для контроля работы сотрудников и получения оперативной аналитики.
Обзор лучших QLED телевизоров, которые есть в наличии в 2023 году
Любите посмотреть кино или поиграть? Для этого созданы QLED-телевизоры. В его основе – технология квантовых точек, которая позволяет достичь максимально точной цветопередачи и делает цвета более яркими, насыщенными и живыми. В результате вы получаете невероятное изображение, которое намного превосходит возможности других ТВ.
Гиперконвергентные инфраструктуры
С постоянным развитием информационных технологий и расширением объемов данных компании сталкиваются с необходимостью улучшить свои IT-инфраструктуры, чтобы обеспечить эффективное хранение, управление и обработку данных.
Бесплатные мероприятия в Москве Cоветы Путешественникам —
как мы переехали
в Мексику
Свежий номер газеты Телеком

«ТелеКом» уходит в интернет!

Как вернуть исчезнувшие контакты на iPhone после обновления iOS?

Мобильный телефон в отпуске – особенности использования и вероятные поломки

Brosco - модные аксессуары для вашего телефона

EmailMarket – онлайн платформа для поиска лучших специалистов в email маркетинге

Большие возможности при разумной цене смартфона Lenovo A Plus

Квадрокоптеры – история вдохновения

Больше возможностей для email-рассылок за умеренную стоимость с SendPulse

Mestel MO900 – семейная микроволновка

Сколько стоит ремонт ноутбуков и куда стоит обращаться в первую очередь?

Заряд бодрости и оптимизма

Внешние зарядные устройства для мобильных телефонов и девайсов

Аккумуляторы для фотоаппаратов и видеокамер

Как выбрать недорогой китайский смартфон

Возврат обеспечения заявки на участие в тендере

Оптические делители

Восстанавливаем потерянные данные программой EaseUS Data Recovery Wizard

Бронебойный высокопроизводительный смартфон Blackview BV 8000 PRO

Autodesk Vault – компоновка и возможности

Как защитить сайт от вирусов

SSL сертификат – зачем он нужен и какой тип выбрать

Как выбрать проектор для домашнего кинотеатра

Коротко о электрогриле Wollmer S807

Керамика в электротехнике и энергетике

Ремонт планшета Леново

В чем преимущество серверной стойки перед шкафом

Прочный деловой смартфон с неплохими характеристиками и стильным дизайном - Doogee T5S

Запчасти для ноутбуков: плюсы оригинальных комплектующих

Такие разные чехлы и аксессуары от Apple

От яичницы с беконом до шокера. Какими бывают чехлы для смартфона

Причины для замены дисплея на iPad Air 2

Картриджи для ленточной библиотеки – выход для хранения данных

Спидтест интернета с инструкцией устранения проблем представлен на новом ресурсе

Выбираем портативное зарядное устройство

Лучшие смартфоны от производителя Homtom

Выбор мастерских по ремонту гаджетов

Сопровождение 1С: быстрый способ избавиться от проблем

Риски использования одноразовых номеров

Как правильно построить и организовать техническую поддержку ИТ инфраструктуры компании?

Можно ли заправить картридж принтера самостоятельно?

Обмен Perfect Money: возможности собственного обменника и альтернатива порталов мониторинга – что выбрать?

Аренда звука – правильное решение при организации мероприятий

VK70604N: продуманная фильтрация и максимальная практичность

Winter is coming: как выбрать снегоуборочную машину для дома

Особенности выбора сервера 1С

Как ускорить старый ноутбук

Продвигаете сайт? Загляните в соцсети. 5 причин важности маркетинга в социальных сетях

Феноменальная история эволюции WordPress. Путь самой используемой системы управления контентом

ТОПовые игровые ноутбуки

Подписка на новости


Информация

Copyright © 2005-2017
technograd.com


Разработка проекта: Издательский дом RMG

E-mail:
[email protected]

Редактор:
[email protected]

Реклама:
[email protected]

Тел. +7 (863) 272-66-06

о проекте>>

Рейтинг@Mail.ru